Среди всех религиозных общин Чешира преобладает христианство, и в частности англиканство. Однако в переписи 2001 года лишь 1/5 жителей были записаны как неверующие, либо как не указавшие свою религию. Граница Честерской епархии англиканской церкви в настоящее время наиболее точно следует за границей графства Чешир, существовавшей до 1974 года, поэтому она включает в себя весь Виррал, большую часть Стокпорта и сам Чешир, а также территорию совета сельского округа Тинтвистл. С точки зрения управления римско-католической церковью, большая часть Чешира попадает в Римско-католическую епархию Шрусбери. Графство имеет немного более высокую долю христиан, чем остальная часть северо-запада Англии.
В Чешире существует мусульманская организация под названием «Исламский форум Чешира», которая связана с Мусульманским советом Британии.
До конца Второй мировой в графстве действовало несколько еврейских иудейских конгрегаций, некоторые из которых были созданы иностранными эвакуированными сообществами из оккупированой Европы. Единственная, что осталась сейчас — это еврейская конгрегация Честера. В Чешире также есть еврейская начальная школа под названием Еврейская начальная школа в Северном Чешире.
Функционируют несколько буддийских центров, в том числе Кагью и центр буддийской медитации Одийана, который проводит занятия по всему графству.
В Уоррингтоне есть сикхская Гурдвара, называемая Храм Гуру Нанак Гурдвара Сикх, построенная индийской общиной.
Согласно переписи 2001 года, религиозный состав Чешира по районам был таким: